在电视剧《生命树》的剧情里，一具尘封十七年的尸骨终被发现。老韩在从机场回玛治县的途中，无意间挖出了这具遗骨。县里很快知晓死者身份，因多杰已无在世血亲无法进行DNA比对，白菊依据与尸骨一同掩埋的匕首，推测此人便是十七年前失踪的副县长多杰。
这把匕首颇具来头，是扎西当年赠予多杰的，上面刻有独特字样。白菊等人起初凭借一张油票查到吴江，随后在吴江后备箱中发现杀害多杰的凶器，吴江被捕，案子看似告破，然而深入探究后却发现并非如此简单，吴江不过是只替罪羊。真正幕后布局之人，乃是孟耀辉。
孟耀辉留下的四条线索
先说尸骨掩埋位置。多杰当年在从机场返回玛治县途中失踪，作为县委常委兼副县长，其失踪县里定会彻查，势必会派遣大量人手在该路段反复搜寻。若凶手欲隐瞒此事，明智之举应是将尸体带至偏远之地藏匿，而非埋于回县城的必经之路。因一旦有人仔细搜查，发现新土挖掘痕迹，极易暴露问题。孟耀辉将尸体埋在此处，唯一解释便是他期望有人能发现。
再说那把匕首。多杰唯一的亲生女儿早已离世，无法进行DNA比对，扎西后来拿着多杰穿过的衣物提取DNA，这在十七年前根本无法做到。所以，确认死者身份的关键便是其随身衣物及物品，尤其是那把刻字匕首。凶手若不想让人认出死者是多杰，理应处理掉匕首，或至少将尸体与匕首分开掩埋。孟耀辉处理两把枪时便是分开掩埋的，说明他明白此理。但他却故意将匕首与尸体留在一处，并非失误，而是有意为之——他想让人认出死者身份。
第三是那张油票。在尸体衣服口袋里发现一张货运公司的油票，该公司法人是李永强，且李永强与吴江有所关联。无论这张油票是凶手不慎遗留，还是多杰自己放入兜里，它出现在此处都不合理。因为一旦被发现，白菊等人定会顺着线索查到运输公司、工作人员，进而查到吴江，再通过吴江查到冯克青。将如此重要的证据留在尸体身上，这个“错误”太过低级，不似意外，更像是有人故意放置。
最后是孟耀辉的那个电话。白菊等人依据油票查到吴江后立即进行询问，此时孟耀辉接到一个电话，并平静询问“查到吴江那儿了？都问什么了？”这表明他早已料到白菊等人会查到吴江，甚至是在等待这一刻。孟耀辉与吴江向来不合，按常理吴江出事他应紧张才对，然而他不仅不紧张，还主动将目光引向吴江，唯一的解释便是他想让白菊顺着吴江查到鑫海矿业及冯克青身上。
除此之外，孟耀辉身上还有一个疑点——他始终未婚。以他的条件，身为本地人，相貌不错，又是鑫海矿业总经理，早该成家立业。可他却一直单身。更为奇怪的是，近期他突然让母亲去找张院长，安排与白菊相亲。为何是现在？为何是白菊？最合理的解释是，他是当年多杰被害真相的知情者之一，多杰曾救过他的命，他一直渴望赎罪，却不敢公然与冯克青作对——他深知冯克青背后势力庞大，惹不起。所以他只能通过这种方式，逐步将线索透露出去。白菊等人若未发现那具尸体，他便借着相亲接近白菊，有意无意地向她传递线索。
邵云飞为什么要留下来
另一边，邵云飞也留在了天多。他与白菊虽已离婚，但一直期望复婚。白菊仍爱着他，却未松口，称要看他的表现。原本白菊已答应带女儿与他一同返回省城，邵云飞也应允回去转做内勤。然而多杰尸骨被发现后，白菊改变主意，决定继续留在天多调查，邵云飞也随之留下。
起初以为他是为了挽回白菊。直至冯克青拿着100万前来贿赂他，才明白他留下来另有目的——报仇。邵云飞此前来天多调查时，撰写了一篇关于煤矿企业问题的报道。稿件即将发布时，他却发现自己被利用了。他原本揭露的是鑫海矿业的问题，见报时重点却被转移到了小煤矿企业身上。鑫海借此报道摇身一变，成为正面形象。
邵云飞工作多年，首次遭遇这种情况，心中愤懑难平。他去找林培生，林培生表示自己并不知情。但林培生是引进鑫海的人，临近退休，不想惹事，也不同意邵云飞继续调查。林培生的理由并非毫无道理——鑫海涉及几万个员工及家庭，一旦出事，责任重大，无人能承担。
林培生的反对反倒激发了邵云飞的斗志。他找到白菊，并借助孟耀辉的关系进入鑫海矿业展开自行调查。冯克青察觉异样后，通过黄局长找到邵云飞，塞给他一张七位数的支票，企图让他收手。
